Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
E2f6O54917 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms