Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Sp100O35892 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sp100O35892 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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