Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Timm44O35857 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Timm44O35857 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Timm44O35857 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms