Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Opn1mwO35599 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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