Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc27a2O35488 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc27a2O35488 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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