Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Prrt1O35449 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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