Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Dgcr6O35347 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dgcr6O35347 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms