Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ArxO35085 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ArxO35085 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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ArxO35085 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ArxO35085 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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ArxO35085 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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ArxO35085 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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ArxO35085 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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ArxO35085 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ArxO35085 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ArxO35085 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms