Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Casq1O09165 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Casq1O09165 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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