Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Eftud2O08810 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms