Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm20878L7N244 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm20878L7N244 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Gm20878L7N244 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20878L7N244 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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