Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms