Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm21976J3QNN2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm21976J3QNN2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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