Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm6594J3QM43 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms