Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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