Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21060J3KMU4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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