Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r167G3UW71 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r167G3UW71 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms