Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srp72F8VQC1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srp72F8VQC1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms