Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arid4aF8VPQ2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms