Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm5798F7BTS7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Gm5798F7BTS7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm5798F7BTS7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm5798F7BTS7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm5798F7BTS7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Gm5798F7BTS7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm5798F7BTS7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm5798F7BTS7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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