Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5218F6YH22 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms