Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Igkv1-99F6XWB2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Igkv1-99F6XWB2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms