Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm5861F6VCN9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm5861F6VCN9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm5861F6VCN9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms