Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc85cE9Q6B2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms