Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm20518E9Q548 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20518E9Q548 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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