Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trappc8E9PWG2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms