Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc175E9PVB3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc175E9PVB3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms