Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syde2E9PUP1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde2E9PUP1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms