Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Vpreb3D3Z6J4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb3D3Z6J4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms