Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd1D3YXK1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms