Protein–RNA interactions for Protein: D3YX71

Gm8973, Predicted gene 8973, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8973D3YX71 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8973D3YX71 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8973D3YX71 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms