Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyp26c1B2RXA7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms