Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usf3B2RUQ2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms