Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Spocd1B1ASB6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms