Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Grik3B1AS29 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms