Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Odf2A3KGV1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Odf2A3KGV1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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