Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp8b5A3FIN4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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