Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn3aA2ASI5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn3aA2ASI5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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