Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Syndig1A2ANU3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms