Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms