Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ambra1A2AH22 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms