Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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