Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Speer3W4VSP1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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