Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Hdac6Q9Z2V5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hdac6Q9Z2V5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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