Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mrpl40Q9Z2Q5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mrpl40Q9Z2Q5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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