Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rs1Q9Z1L4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms