Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Psma4Q9R1P0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms