Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slit2Q9R1B9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms