Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Plod3Q9R0E1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Plod3Q9R0E1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms