Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf4Q9QZS2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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